此时无论箕子还是比干都已经风烛残年，而微子启才是更受欢迎的继承人。所以王室宗亲事实上形成以微子启为核心的集团，以推翻帝辛为目标。但这个目标可能并不没有被箕子和比干知晓。
在微子的暗中策划和游说下，箕子和比干出于对帝辛的忠心而不断上书，终于激怒帝辛，认为他们结成反对他的集团，箕子因为更加具有贤名，帝辛不敢杀他，所以软禁了他。而比干名声不如箕子，而被杀，不过，被杀的比干的名声迅速超过了箕子。
虽然帝辛没有得到微子是幕后主谋的证据，但是也成为重大嫌疑人，微子得到风声，迅速携带商王室宗庙礼器（包括祭器和乐器），逃离朝歌，回到了封国微（山西长治潞城市）。微子的人生观又与比干不同：“今诚得治国，国治身死不恨；为死，终不得治，不如去”，意思是真心想要为国家出力，如果国家能够富强，自己就算身死不心甘情愿，但现在的情况是就算自己身死了，国家也不能富强，不如留待有用之身，以待时局。
帝辛见微子逃离也就不再追究其是否为主谋，也根本不在意其携带礼器之事。但微子却惧怕帝辛可能的捉拿，而带着国民由山西迁到了山东梁山，也称为微。这里与朝歌更远，微子得以心安。
微子虽然离开朝堂，但因为箕子与比干的旧部的关系，其在朝廷的潜势力极为强大，对商朝的情况了如指掌。
微子在了解了周武王孟津会盟的情况之后，认为可以借助诸侯的力量推翻帝辛的统治而自己称王，所以其派了两个人求见周武王。
周武王自从孟津会盟之后，一直担心帝辛发动大兵袭击自己。但不久之后闻听箕子被软禁、比干被杀，而微子出逃以后派代表求见周武王。微子的代表将朝歌兵力空虚，主力在东夷镇守的情况，透露给周国君臣。姜太公：“大喜，天助周国，当得天下。”
而后来微子的代表答应为周师引路，甚至直接帮助说降心向微子的守军。实际上微子等王室宗亲普遍对周的印象很好，且是商的外戚，向他借兵，并不成问题。没有想到周的目标是颠覆商汤基业。
太祖对微子的评价：“……微子最坏，是个汉奸。他派两个人作代表到周朝请兵。武王头一次到孟津观兵回去了。然后又搞了两年（由《竹书纪年》知第二年就打败了帝辛），他说可以打了，因为有内应了。纣王把比干杀了，把箕子关起来了，但是对微子没有防备，只晓得他是个反对派，不晓得他里通外国。”
周王朝建立，定都镐京（今陕西西安
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