这其实是碰巧了，因为此时正是全新世开始，即第四纪冰期的最后一次冰期结束不久。之前《史前大洪水》章节中详细介绍了前因后果。
这次由海啸引发的洪水之后，世界范围内海平面大幅上升，从此中国大陆与日本、台湾和印度尼西亚分隔开来。并且洪水将中国大陆的东南部淹没，即使华北地区也被淹没，只有蒙古高原和西北地区未被淹没。祝融氏的短暂统治结束，燧人氏开创的帝都灵台（河北徐水）也被淹没。史前时代中期结束，世界历史进入新石器时代。
伏羲因为领会了八卦，对天气的变化较普通人更加敏感，他预测到了即将发生空前的洪水灾难，于是号召族人们跟随他向西迁徙。由于平时人们发现他对天气的预测比较准确，所以纷纷呼应他的号召。而他也没有忘记通知他的母家有娲氏部落，他们对他也比较信任，于是两个部族结伴撤向西方。
在撤退的过程中，洪水果然发生了，两个部族加紧行动，终于在洪水到来之前，登上了六盘山。山上有很多猛兽，由于人类侵入到了猛兽聚居的地方，引起猛兽的攻击。虽然逃往山中的其它各族人类也不少，但是经过猛兽的侵袭，活下来的就很少了，抱团的伏羲部落和女娲部落幸存更多。他们以六盘山为主要防御洪水的前沿，主要分布在甘肃至青海一线。今天甘肃天水还存留有伏羲庙，始建于明代成化年间，后经九次重修，形成古建筑群。
两个部落成为东部幸存的少数族群，于是开始互相通婚，结成部落联盟。至于说兄妹什么的，实际上两个部族都是燧人氏的后代，所以也能搭上边，但事实上他们仍然是实行族外婚，已经算是近亲了。伏羲作为联合后的第一任族长，成为大洪水之后的第一位联盟共主。
伏羲模仿自然界中的蜘蛛结网而制成网，教会了人们用网捕鱼的方法，改进了人们的渔猎技术；同时教民驯养野兽，其部落是当时最早驯化家畜的部落。
伏羲始造文字，用于记事，取代了织女发明的结绳记事。
据司马贞《三皇本纪》载：“太昊伏羲氏，日月象其明，龙河马图神其应，洩阴阳之秘，奥八卦爻象之先，配干支，作甲子。作二十五玹之瑟，龙师纪官。始庖厨，倡六兽，之先帝也。端拱于上，诸臣分理于下。”
伏羲发明二十五弦之瑟，创作乐曲歌谣，将音乐带入人们的生活。开创了中华菜肴的制作。
伏羲取蟒蛇的身，鳄鱼的头，雄鹿的角，猛虎的眼，红鲤的鳞，巨蜥的腿，苍鹰的爪，白鲨的尾，长须鲸的须，创立了中华
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