虽然李成梁己经解职，但是努尔哈赤和李家仍然保持密切联系。
万历二十年抗倭援朝战争爆发后，李成梁的长子李如松率军赴朝作战。努尔哈赤申请派兵跟随李如松入朝，明廷没有批准。
努尔哈赤为什么要申请赴朝作战，是谁出的主意，朝廷为什么不批准，不得而知，但是这件事情充分显示了努尔哈赤与李家不同寻常的关系。
此外，努尔哈赤的侄女嫁给了李成梁二子李如柏为妾，并生有一子，努尔哈赤与李家好上加亲。
万历二十五年冬，李如松从朝鲜战场得胜归来，接替董一元任辽东总兵，海西四部一看努尔哈赤的靠山回来了，急忙见风使舵，一同派出使者到费阿拉向努尔哈赤谢罪，他们的使者对努尔哈赤说：“以前是我们不对，以至兵败损名，从今以后，我们要和好如初，互相结亲。”
第二年四月，蒙古土蛮寇犯辽东，李如松率轻骑远出捣巢，中伏战死，其弟李如梅接任辽东总兵。也许是受到李如松战死的影响，李如梅变得明哲保身，很少出战，不久因“拥兵畏敌”之罪被撤。
万历二十九年，李成梁老树开花，以七十五岁高龄，再次出任辽东总兵，在辽东又镇守了八年。
努尔哈赤利用这一段时间取得了对海西女真的绝对优势，灭哈达、辉发、蚕食乌拉，兼并女真的野心逐渐暴露。
万历三十四年，李成梁放弃六堡，把居民迁到内地，部分居民不肯离去，李成梁派兵驱赶，杀死不从令者，李成梁却以招复逃人为名向朝廷报功，增秩受赏。
对于放弃六堡这件事，大多数人持否定态度，认为这是李成梁自毁长城，将八百里国土拱手让于努尔哈赤，是卖国行为。但从另一个角度看，李成梁此举也是为了遏制努尔哈赤。
明朝遏制女真的手段主要有二：一是经济手段；二是军事手段。
李成梁与努尔哈赤的特殊关系，不可能撕破脸皮大打出手，只有采取经济手段。
六堡作为明朝与女真的结合部，是汉人与女真人联系的桥头堡，明朝先进的生产力和先进文化通过六堡传到建州女真地区，客观上促进了建州女真的发展壮大。
这种促进不仅体现在经济文化上，也体现在人口素质上。六堡地区经过几十年的发展，人口不断增加，己经达到六万户，人口在二十万以上。建州人口稀少，一旦打仗就没有人从事生产，极其需要人员来发展生产，扩充队伍，因此人口对建州来说是很宝贵的财富，随着努尔哈赤占领的地盘越
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