遂至摘星楼强谏三日不去。纣问何以自恃，比干曰：“恃善行仁义所以自恃”。纣怒曰：“吾闻圣人心有七窍信有诸乎？”遂杀比干剖视其心，享年66岁。葬于河南省卫辉市。
比干夫人妫氏甫孕三月，害怕祸及到身，逃出朝歌，在长林（河南新乡卫辉市）石室之中而生男，名坚。
而在《封神演义》中是这样记述比干之死的：
鹿台完工后，纣王听信妲己妖言，欲会见仙姬、仙子。妲己心生一计，于十五日夜请轩辕坟内众妖狐变成仙子、神仙、仙姬来鹿台赴宴，享受天子九龙宴席，迷惑纣王。
席上，狐狸骚臭难闻。功夫浅薄的妖狐竟露出了尾巴。宴席上的纣王叔比干看得十分真切，宴后将此情告知武成王黄飞虎。经查，众妖狐都是轩辕坟内的狐狸精。比干便与武成王黄飞虎领兵堵塞妖狐洞穴，放火将狐狸尽行烧死。比干还拣未烧焦的狐狸皮制成一件袄袍，严冬时献于纣王，以慑妲己之心，使其不能安与君前。妲己见袄袍尽是其子孙皮毛制成，心如刀割，深恨比干，誓挖其心。一番思索之后，妲己找来雉鸡精胡喜媚，两人决心共同设计害死比干。
忽有一日，纣王正与妲己以及新纳妖妇胡喜媚（雉鸡精）共进早餐，忽见妲己口吐鲜血，昏迷不醒。喜媚道是妲己旧病复发，常有心痛之疾，一发即死。冀州有一医士张元，用药最妙，有玲珑心一片煎汤吃下，此疾即愈，纣王便要传旨宣冀州医士张元，喜媚对纣王说朝歌到冀州路途遥远，并推算说在朝歌惟有丞相比干是玲珑七窍之心，可借一片食之，纣王信以为真，即命人急召比干。
比干闻之，既怒且惊，由于先前姜子牙离开朝歌时，曾去相府辞行，见比干气色晦暗，知其日后必有大难，便送比干一张神符，叮嘱在危急时化灰冲服，可保无虞。比干入朝前知己必难，便服饮姜子牙所留符水。比干来到鹿台下候旨。
纣王听到比干来到，对比干说妲己心痛之疾，惟玲珑心可愈。听说皇叔有玲珑心，乞借一片作汤，治疾若愈，此功莫大焉。比干怒奏：“心者一身之主，隐于肺内，坐六叶两耳之中，百恶无侵，一侵即死。心正，手足正；心不正，则手足不正。吾心有伤，岂有生路！老臣虽死不措，只是社稷丘墟，贤能尽绝。今昏君听新纳妖妇之言，赐吾摘心之祸；只怕比干在，江山在；比干亡，社稷亡！”纣王曰：“皇叔之言差矣！总只借心一片，无伤于事，何必多言？”比干厉声大叫道：“昏君！你是酒色昏迷，糊涂狗彘！心去一片，吾即死矣！比干不犯剜心之罪，如何无辜
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