改邪归正，成为除暴安良的义士。当时在黎巴嫩森林中有位看守杉林的魔妖洪巴巴，他凶狠残忍，杀害无辜，还斗胆劫持女神伊什塔尔（埃安娜，乌鲁克守护神），将之囚禁山顶。吉勒伽美什决心为民除害，讨伐洪巴巴，但恩启都得知此事，认为力量太小，不愿行动，可吉尔伽美什一意孤行，恩启都只得随行。
他们殊死相搏，后在太阳神乌图（苏美尔时称乌图，巴比伦时称沙玛什）的庇护下才消灭洪巴巴，救出伊什塔尔。
当时洪水的威胁很严重，每年两河流域都会洪水泛滥。基什王阿伽自恃是大邦之主，有权有势，为了兴修堤坝却不想出人出力出物，反而强迫弱小的乌鲁克。实际上当时乌鲁克可一点也不弱小，这应该是由乌鲁克创建的史诗。
基什王阿伽遣使要求乌鲁克王吉勒伽美什派人为基什挖井修渠，并威胁说，若不从，即兵戎相见。吉勒伽美什召开城市长老会议，以决定战与降，长老会议主张投降。他又召开公民大会，公民大会主张拒绝基什的要求，进行抵抗。
作为乌鲁克之主的吉勒伽美什，沉着应对，不畏权势。诗歌将吉勒伽美什作为一位受人民爱戴的小城邦的首领与英雄来刻画和颂扬。
想想连基什国王都被人活捉了，还能说乌鲁克弱小吗？
阿伽对乌鲁克的压榨是有原因的，就是想要削弱乌鲁克的力量。
后来基什王果然来攻，却败给了吉勒伽美什的统兵大将恩启都，阿伽被生擒，按照史诗所说，其被释放，但众多邦国都不再承认基什的王权，而承认乌鲁克的霸主地位。
这一段故事可能并不是真相，因为如果真的释放了的话，那么苏美尔王表就不会只显示到阿伽为止，他的后代呢？所以结果应为比较正常的：阿伽被杀死，基什的王统断绝。至于释放属于后人的艺术加工，没有考虑历史的前后逻辑问题。
战争的结果出人意料，但也在情理之中，毕竟从历史上看基什与乌鲁克的战事，例来败多胜少。虽然乌鲁克才刚刚走出混乱，但是乌鲁克在战场上依旧表现出了强大的力量。
BC2914年，吉勒伽美什攻占了基什。乌鲁克成为美索不达米亚新的政治中心。
埃兰前王朝国王胡姆班·哈普阿一世在吉勒伽美什胜利后，向吉勒伽美什表示臣服。
此后即形成传统：当苏美尔地区的君主强势的时候，埃兰就会向其屈服，如果统治混乱，则埃兰就会拒绝臣服。似乎埃兰内部很容易形成统一意见，并且往往以国王的意见为各邦国
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