认天主教，那么教堂和教会就没有存在的必要了，但是热衷于传教的葡萄牙人是不可能坐视教堂被拆毁，传教士被驱逐的，但是也不愿意就此得罪大明，按照早先定好的计划，由施罗宝代表葡萄牙国王劝说教会离开，劝说无效之后再由大明动用武力，最终产生的妥协方案是，教堂不能被拆除，而是转变为葡萄牙商馆，而教会人士跟随施罗宝前往京城，进驻葡萄牙使馆，毕竟使馆是葡萄牙的领土了，在那里做什么大明管不着了，只是传教士不允许向大明百姓传教罢了。
第二个令人头疼的是大明设立在澳门的官员，虽然两广总督兼广东巡抚的沈犹龙对北京是极为亲顺的，但是还未曾正面表态过，在长山海战之后，沈犹龙曾接触过沈廷扬，希望尽早改换门庭，但是却被孙伯纶安抚下来，如今的广东可不是唐宋时代了，在大明十三省中，广东也是富庶之地了，南京朝廷是不会放任广东投靠孙伯纶，夹击自己的，而孙伯纶也不想这么早与南京开战，原因很简单，同样的钱投入到海军，投入到东南亚，日本乃至美洲，甚至去开发未曾被人发现的澳洲，对日后的世界格局都会产生巨大的影响，何必用在内耗上呢。
因此，沈犹龙与大明的关系一直未曾公开，童海峰这个水师将领自然也不知道，无奈之下，他只能把广州府安置在这里的官员礼送出境了，让广东失去了这个每年可以收两万两的税收宝地。
解决了两大问题之后，童海峰发现，秦王根本不准备派遣官员前来，而是把整个澳门全部交由了水师管辖，作为水师进攻马尼拉、巴达维亚、马六甲等东南亚地区据点的前哨站。
也就在澳门交接完成之后，南海舰队正式成立，童海峰终于获得了独镇一方的机会，只是划拨给他的只有四艘主力舰，其余都是双桅纵帆船，而童海峰获得的任务不是攻打巴达维亚或者马尼拉，而是对南中国海上的西班牙和荷兰船只进行破交作战，在童海峰看来，这就是官方海盗行为，但是却坚定不移的执行了。
随着南海舰队破交作战一起下达命令的是对所有大明商船发出的私掠许可令，即大明与荷兰、西班牙两国处于战争状态，所以在任何区域对两国的商船进行抢掠都是合法，抢掠所得可得到朝廷认可的。
私掠许可令的颁布让大明更多的财力投入到海贸之中，而盖伦式武装商船逐渐取代了福船等一众大明的旧式船只，成为了远洋海贸的首选，在私掠许可令颁布的半年之后，印度洋上就出现了大明的武装商船劫掠荷兰商船的情况，而那一次的冒险却带来了丰厚的回报，那艘
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