做完最基本的安排以后，人心初步稳定下来，接下来李鸿基就该显示一下自己的武力了，每个定居点里抽调一部分人参加军队，采取自愿的原则，不过凡是参加军队的家庭都可以享受免税的待遇，而且家庭还可以得到李鸿基的先进农具，更本不用担心劳动力问题，只会生活得更好。
在每个定居点里，想要参加军队的人还是非常多，因为在游牧民族的心理上，武力至上深入人心，这是历史的沉淀，天性使然，谁都想更强大一些，成为让别人钦佩、尊敬的的人，而且游牧民族的成年人都是天然的骑兵苗子，非常好斗。
招收到大量士兵以后，李鸿基就让各级军官军官们去系统训练这些新兵，步兵是不用这些人，他们对于大明的先进步枪、迫击炮的使用很难理解，训练很麻烦，李鸿基也没有太多的时间可以浪费，直接给他们配备了马刀、战马，这些人都是在马背上长大的，天然的骑兵苗子，极少数种地的农奴就根本没有参加军队的资格。
军队的训练还是从基本的配合为主，他们不缺乏骑马的技能、战斗的技巧，最缺乏的是战场纪律，军官们在训练中特别向他们强调的就是战友之间的配合。朱有孝来自后世，自然就会将后世的许多拓展训练方式交给军校的军官们，训练项目包括：逃生墙、信任背摔、孤岛求生、飞行转轮、依存共渡、雷阵、智闯敌营、激流勇进、穿越沼泽、穿越弯桥、巧过网阵、困绝墙、地面荡木桥、跨越高网、跨越巅峰、悬降塔、网攀架、梅花桩、金字塔、人生棋盘、障碍台、露营、野炊烧烤、定向越野、野外生存、神秘拼图、崖降、峡谷探幽、登山、定向探宝、、洞穴探秘、峡谷穿越、高空滑索、水幕溪降墙、抽板过河、水上梅花桩、浮桶架桥、水上单索、跨越大峡谷、水上拉练、水木囤、勇渡、抬圆木等。
严酷的百日训练过后，这些新兵蛋子们终于明白了李鸿基军队的强大战力来源，深刻的理解了团队作战的威力。为了让这些新兵更好的适应这种新鲜的作战方式，李鸿基还专门安排了数次实战演习，让自己的亲兵卫队三十二人组成的小队和新兵进行对战，无论是三十人组、六十人组、还是百人小组的新兵，在李鸿基的卫队面前都是失败，这就更加坚定了他们的训练决心。
两万多新兵经过百日的艰苦训练初步成型，这样李鸿基就有了三万的士兵，将要带兵的将领只有三人，那就是刘宗敏、刘芳亮、袁崇第，田见秀和李过负责这里的民事问题和后勤问题，他们一般不再直接参与战事，毕竟李鸿基并不善于管理这些。
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