沐王府投降之后，方原对云南的军政进行整改。
先是取消了沐王府在云南的军政之权，交由云南布政司接管。之前的云南布政司巡抚，还有布政司所有的官员，因未能履行巡抚之职，与沐天波沆瀣一气，通通罢免官职，打发回了老家。
方原从广东、广西、湖广等邻近的布政司，调任了官员前来云南布政司任职，接管政务。
唯一未确定的，是云南总督，云南巡抚之职。
总督统管军政事务，而巡抚一般情况下只巡视政府，不能干涉当地的军权。
沐王府在云南有着很高的声望，要尽快令云南各州府的土司归降，稳定云南的大局，由沐王府的人出面去和这些土司打交道，能起到事半功倍的效果。
所以云南巡抚之职，方原还是给了投降归顺的沐忠罕，其主要职责就是安抚云南各地的土司，还有滇民。
沐王府的家眷上百口，沐氏族人数千人全在方原的手中当人质，而且区区一个巡抚之职，并没有军权，方原也不担心沐忠罕还能翻出什么大浪来。
若沐忠罕真的投了降，为朝廷效力，可以将他留任在云南。若他还有二心，大不了再派兵前来征讨，沐王府十万军士都被击垮了，一个沐忠罕还能做什么？
因关系到沐王府的存亡，还有父亲沐天波的回归，沐忠罕并没有推辞，领了云南巡抚之职，开始带着一、两百亲兵前去云南各府安抚各地土司，告知沐王府已被取缔，由朝廷任命总督、巡抚前来管理的最新情报。
更重要的是，沐忠罕要亲自去缅甸，规劝父亲回归大明，向方原认罪，接受朝廷的律法处治。以方原对沐王府的宽容，只要沐天波认罪伏法，应该是没有性命之忧。大不了就永不录用，赋闲在家，监视居住，总比流落在缅甸这种异国他乡好吧！
沐忠罕担任了云南巡抚，至于云南总督一职，方原暂时没有任命，只是令秦展、纳吉二人率四万闽广步卒留在昆明城改编投降的数万滇军，迅速整编出一支熟悉云南环境，至少十万以上的军队。
因缅甸国是敌是友，动向不明，方原要先做好出征的战备。若缅甸王能送归沐天波，那是最好不过。若缅甸王胆敢袒护沐天波，只能出兵缅甸，不止要捉回沐天波，连缅甸国也顺道灭了。
方原则准备率两万从北京打来的精锐步卒北上讨伐还在贵州为祸的李定国。
当然，在出征之前，方原还在等一个消息，就是吴三桂、郝摇旗二人运粮前去支援甘辉的战果。
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