三之丸之后，首先开始纵火，然后见人就杀，一时间三之丸成了人间地狱。在施大瑄的屠杀和驱赶之下，走投无路的三之丸居民被逼着往二之丸逃去。而三之丸的大火也蔓延到了二之丸。
施大瑄在夺取三之丸之后，并没有立刻对仙台城的二之丸发起攻击，而是退出了三之丸，在城外进行修整，现在三之丸在一片大火之中，根本无法逗留。
三之丸的大火一直烧到了晚上才逐渐熄灭，整个三之丸变成了一片废墟，就连二之丸都被烧毁了三分之一。
十一日，施大瑄对二之丸发起了攻击，相对于三之丸，施大瑄感觉对二之丸的攻击要轻松许多，也许是昨天仙台城的居民被九州军杀怕了，施大瑄的大军势如破竹一般就夺取了二之丸。
十二日，九州大军又夺取了仙台城的本丸。虽然本丸抵抗非常激烈，但面对士气高昂的九州军，本丸的守军也仅仅抵抗了大半天的时间。
夺取仙台城之后，为了报复仙台城的百姓，郑芝虎下令紧闭四门，全军对仙台城进行了屠城。十五万大军同时进行屠城，仅仅两天之后，整个仙台城就被屠戮一空，最后仙台城存活下来的只有一万多妇人，这还是郑芝虎下令留下来的。
夺取仙台藩，为九州大军提供充足的粮饷，而夺取仙台城所获的财富足以弥补此次出征幕府全部的军饷。到现在郑芝虎才明白真正的以战养战说到底就是劫掠，而屠城是以战养战的最高境界。
夺取仙台藩，使得摇摆中的米泽藩改旗易帜，宣布加入九州军。米泽藩的上杉氏在关原之战之前一直与德川氏处于敌对状态。在德川家康夺取天下之后，上杉氏受到了处罚，虽然德川家康没有全部没收上杉氏的领土，但却将其石高降到三十万石，这使得上杉氏对幕府的忠诚度一直不高。
米泽藩的投降，使得整个本州东北再也没有力量抵抗九州大军。九州大军开始积极地从进攻转入防守，准备防御从江户派出了十万的大军。
而九州军装备了先进的天启枪的消息此刻也传到了江户，使得从江户出来的援军改变了初衷，从进攻变成了防守。而幕府也开始积极寻求购入天启枪，只不过大明与九州的关系紧密，幕府无法从大明购入天启枪，他们不得不想办法想从西洋人手里购入天启枪，而西洋人的天启枪才开始换装，他们现在连自己都无法满足。
失去本州的东北，使得整个关东地区都暴露在九州大军面前，而且使得本来财政就困难的幕府现在更加困难，在接连不利的消息之下，德川家光病倒了。
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