安排完相关事宜后，孙宇再次进入了冬眠。
这次，他设定的苏醒日期是危机纪元16年。
同时，大批的神盾局高管，也进入了冬眠状态。
神盾局则交给了史蒂夫·罗杰斯，统筹接下来十二年的工作。
危机纪元12年……
三体舰队距离太阳系4.18光年……
林格斐兹罗望远镜发现了三体舰队探测器，既水滴……
太空电梯投入运行……
章北海趁着孙宇冬眠，暗杀了航天部三元老，为无工质飞船的研发奠定了基础。
完成自己的任务目标后，章北海进入了冬眠。
危机纪元16年。
孙宇苏醒了，当他看到霍华德·斯塔克，已经从小青年变成了大胡子后，方才感受到了已快速流逝的岁月。
这一年，希恩斯夫妇苏醒了……
“思想钢印”被成功研制了出来。
他们夫妻二人建立了信念中心。
希恩斯完成了当年的承诺，将其中一台“思想钢印”秘密转移给了孙宇。
如获至宝的孙宇非常高兴，立刻就将“思想钢印”的原理解析了个透彻，并销毁了希恩斯送过来的样机。
只要得到原理就可以了，孙宇有着更高超的打“思想钢印”办法。
也就是在这一年，孙宇给神盾局“增援未来”计划内的100万冬眠者，全部打上了思想钢印。
几个月后……
曼努尔·雷迪亚兹被破壁成功……
而他使用的策略，就是同归于尽战术。
在面壁计划听证会上，雷迪亚兹使用了核弹作为威胁，用以恐吓参会代表。
这也使得他激起了众怒，愤怒的民众要当场绞死他……
在飞回委内瑞拉的途中，孙宇秘密派人将雷迪亚兹劫持到了神盾局，并强行使他进入了冬眠。
将事先准备好的ETO人奸，整容成雷迪亚兹的模样，使用全贯通式脑机芯片加纳米虫进行控制，使得这个人奸被愤怒的百姓当成了雷迪亚兹，而被乱石砸死。
做完这些。
孙宇再次进入了冬眠。
而这一次，他的两个孩子将随同母亲一同冬眠。
这一阶段轮值局长，恢复成了佩姬·卡特……
危机纪元26年……
在孙宇的授意下，佩姬·卡特公布了肉制品种植技术。
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