伴随着第五使徒的毁灭，NERV总部的危机暂时被解除了。对于大多数人来说，他们很快就恢复了原本平静正常的生活。
但是对于赤木律子等人来说可就不是这样了，在那天之后，赤木律子就几乎废寝忘食，想要搞清楚，当时挡住了第五使徒那一击的究竟是什么！！
那不是AT力场，也不像是任何目前已知的科学手段能够解释的现象，甚至在对当时的观测数据进行了一次又一次的解析之后，赤木律子只能够得出一个让她自己都不相信的结论———那就是在那个神秘的蓝色光盾出现的时候，四周的一切物质仿佛都停止了变化，就好像强行被人为的凝固了一样，形成了某种无法被解析的神秘构造。
而在这种构造下，别说是第五使徒的那次攻击了，就是把那攻击威力叠加十倍都不可能摧毁这面防护屏障！
这一点儿都不科学啊！那股神秘的能量来源在哪儿？它是如何进行作用的？为什么无法被观测到？
赤木律子百思不得其解，技术部的人更是头发都快掉光了也没找出原因所在。至于绫波丽自然也被留在了总部，进行各种各样的调查和身体检查。不过结果也没有太大变化，毕竟当时的绫波丽所做的事情全部都有记录，至少从表面来看，绫波丽并没有做什么特别奇怪的事情，EVA的操纵记录也很正常………
目前绫波丽还被留在总部接受调查，不过方正并不担心她的安全。毕竟方正可是给绫波丽身上施加了安全防护的，如果那些白痴真的蠢到敢伤害绫波丽，那么方正大不了直接撕破脸皮弄死他们罢了。
区区一个NERV罢了，就是把这个世界的所有战斗力加起来，都比不上方正一根手指，目前方正之所以选择从暗中推动，只是因为这样比较容易建立后时代的秩序。毕竟如果能够彻底扫除SEELE和NERV的话，那么接下来这个世界的地球依旧可以按照自己的方向慢慢发展，简单来说就是善后比较方便。
但是如果让方正直接出手的话，就意味着天道宫的全面干涉，就好像外星人试图统治地球一样………多少善后会有些麻烦就是了。
简单来说就是，目前方正只想要解决目前这个世界的危机，但是不希望给他们搞售后。
但是如果NERV作死的话，那么方正不介意连售后服务一起给他们搞了。
也正因为如此，在赤木律子在总部对着绫波丽和一堆无法言明的数据苦恼之时，方正已经带着碇真嗣连同葛城美里一起来到了太平洋上空。
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