钱谦益为首的东林党的官员以立贤为名，拥万历皇帝同胞弟弟潞王朱翊镠之子朱常淓为帝。
而东林党的另外一个大佬，南京兵部尚书史可法则主张既要立贤也要立亲，故而拥立神宗七子桂王朱常瀛为帝。
为了反对朱由崧继位，史可法罗列了其七大缺点，即：贪、淫、酗酒、不孝、虐待下属、不读书和干预官吏，说朱由崧“在藩不忠不孝，恐难主天下”。
由于支持朱由崧的马士英和卢九德是外臣，自然不比南京城里的钱谦益和史可法在南京的影响力大，故而在争位一事中处于下风。
可朱由崧也有一个巨大的优势，那就是马士英手里掌握着江北大军，而卢九德也是南京的监军。
故而，为了让朱由崧登基马士英率兵亲自将其送到南京浦口，魏国公徐弘基等渡江迎接。
这使得南京城上下皆惊，谁都知道马士英此举是护送朱由崧登基，而南京城的军队当年被百余名倭寇逼得紧闭城门，战斗力可想而知。
再者说了，卢九德在南京军队中也有不少人脉，与马士英作战唯有惨败一条，这使得钱谦益和史可法等人不得不同意朱由崧继位。
因此，南京百官迎见朱由崧于龙江关舟中请其为监国，毕竟这个时候太子和定王、永王下落不明，无法直接让朱由崧登基。
这个时候，按照惯例朱由崧和南京的官员们玩起了劝进的把戏，朱由崧推说自己未携宫眷一人准备避难浙东而已，并不愿意当监国，在众臣力劝几次后这才勉强同意。.
半个月后，朱由崧在南京城皇宫武英殿登基为帝，改元弘光，成为了历史上的弘光皇帝。
值得一提的是，朱由崧监国后发生了一件震动南京城的大事，有自称太子朱慈烺的人抵达了南京，言明李自成在山海关战败后伺机逃了出来，要求登基继位，挥兵北上为崇祯皇帝和被屠戮的百姓报仇雪恨。
南京城的官员们被这个突如其来的太子惊得不知如何是好，太子在京城的时候久居东宫甚少露面，以免私交外臣。
因此，除了那些朝廷重臣外连史可法和马士英这样的南直隶大员都没有见过，因此自然无法辨别真伪。
随着京城被大顺军攻破，京城的文武官员悉数成为了大顺军的阶下囚，这使得那些认识太子的人都被困在了京城，自然无人辨别其真伪。
朱由崧得知此事后下令将其关入兵马司监狱，然后命让文武百官在午门外审理那名太子，结果其对皇家事务对答如流，令众官员一派
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