地狱为魔兽地狱，第三层地狱为饥饿地狱，第四层地狱为灼烧热地狱，第五层地狱为极寒地狱，第六层地狱为无限地狱。
在第一层的红莲地狱里，那里所囚禁的犯人罪行并不是很严重，在这里拥有一片像森林的地方，在这里生长着一种奇特的“剑树”，那树上面的树叶就像是刀片一样能够切开任何的东西，在这里的地面上又有是像针一样能刺穿人体的“针针草”，在这里，因为大监狱里面的毒蜘蛛和狱卒的追赶，囚犯们会来回的奔跑，然后会被“剑树”的叶子和“针针草”弄的鲜血直流，囚犯们的鲜血流下，染红了这些“剑树”的叶子和“针针草”，像极了红莲，也因此红莲地狱因此得名。
第二层的魔兽地狱，在这里拥有着许多的凶残凶暴的魔界魔兽，在这里最大的就是巴基里斯克，老大是斯芬克司，关押在魔兽地狱此层的囚犯，是会成为这些凶暴凶残的魔界魔兽的粮食，所以，在魔兽地狱此层的囚犯知道自己会成为那些凶暴凶残魔界魔兽的粮食，是连害怕的力气都是没有的。
第三层的饥饿地狱，这里是第四层灼热地狱往上，在这一楼层呢囚犯不会得到任何的食物和热量，这一层地狱的囚犯也只有忍受饥饿，饥饿地狱也是因此而得名。
第四层监狱是灼热地狱，在这里气温是非常高的，这里全是沸腾的血池和火海，如同是一个巨大的铁锅，囚犯在进入深海大监狱时会通过这一层被灼热以此达到消毒的目的，同样的，这一层也有着深海大监狱大监狱长麦哲伦的办公室。
第五层的监狱是极寒地狱，身处此层的囚犯都是大海之上，悬赏金额达到上亿的海贼，这里的环境温度是极低极低的，这里的温度比大冰库的温度还要低，处在这一层的囚犯会被这里的极低的温度冻伤然后直到死亡，在这一层的地狱里也是有着森林的存在的，而且在这里的森林里海被喂养有大量的军狼，同样的，也是因为这里的极低的温度，电话虫也无法在这里生存，所以，这一层是没有安装电话虫监视的。
第六层的监狱是无限地狱，在这一层监狱里的人，没有一个是简单的存在，这里关押的人不是终身监禁之人就是死刑犯，在原著之中，小丑巴基和人妖王伊万科夫说过，在这最后一层监狱无限地狱里所关押的罪犯，都是过于凶恶而从历史之中抹消的怪物级的人物，都是些实力十分强劲的家伙。
在原著之中，在深海大监狱的第五层极寒地狱和第六层的无限地狱之间是存在一个五点五层的地方的，这里被称着是人妖乐园，这里是从深海大监狱的下水
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