京都方面简洁一点来说，毛利元就忙着拆大内家的破船时，织田信长正在埋头搞尾张、美浓的统一事业；‘东国三小强’的今川灭亡后，武田和后北条都在各自想方设法的开疆扩土。而京畿之地却飞跃出了一个天下人，他就是三好长庆。其建立的霸权就被称为‘三好政权’。正是这个三好政权，彻底的埋葬了原本在京畿呼风唤雨的细川政权。
足利义辉成为征夷大将军后，在他的门下，不论是什么剑士、斗鸡士，连歌师都要招揽。
自从明智光秀‘转仕’足利义辉后，他一面替足利义辉训练铁炮队，一面倾心与公卿、幕僚交往，在京畿是混得风生水起。而足利义辉急着重用他的原因则是准备用他来解决掉自己的心腹大患——三好筑前守长庆。
当时，渴望亲政的足利义辉，与把将军当做傀儡的三好长庆，关系已然是非常恶化了。
三好长庆原本还是京畿管领细川家的家臣、家宰。至于为何会与主家反目成仇也需要从其父说起。
在三好长庆之前，掌握大权的还是阿波细川家的细川晴元。而三好家原本还是阿波细川家的家宰。成功讨伐了细川高国后，细川晴元忌惮三好长庆之父三好元长的威势，与其反目成仇。之后，细川晴元在谋臣木泽长政、猛将三好宗三（三好元长的叔叔）的帮助下，先借助本愿寺一揆，攻灭了三好元长，而后又利用法华一揆（日莲宗一揆），将本愿寺赶出了京都。接着，细川晴元再利用日本旧佛教大寺延历寺、三井寺，并联络近江大名、管领代六角定赖，攻灭了法华一揆。在一连串的组合重拳打击下，细川晴元终于安顿了，就任了幕府管领的役职，重新竖起了‘细川政权’的大旗，将第十二代将军足利义晴当做手中的玩偶。
可是，细川晴元机关算尽，但是他还是忽略了一个命中的克星，那就是三好元长的儿子三好长庆。这也不是细川晴元的问题，当时一个只有十岁大的孩子怎么能让细川晴元产生畏惧呢？再加上木泽长政的建议：“三好家毕竟是阿波细川家的家宰，历代皆为阿波细川出生入死，如果灭了他们，以后谁还会为阿波细川家安心奉公？”
就这样，三好长庆和几个弟弟在四国阿波活了下来。但是细川晴元怎么会想到自己当年心一软却留下了一个巨大的隐患。
天文八年，十八岁的千熊丸元服，得名三好孙次郎长庆，正式接过亡父的遗领。接下来三好长庆做的第一件事，不是向主君谢恩，而是直接带着两千五百军势渡过了纪伊海峡，登陆后联合游佐长教直接朝京都杀来。
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