尽管后世对美国是否事先知道日本的偷袭计划有所争论，但在当时，这场灾难性事件被认为是FBI的重大情报失误，美国媒体甚至写道，“国内的超级侦探、联邦调查局局长埃德加·胡佛成为众矢之的”。
胡佛则称“夏威夷事务的管辖权主要属于海军”。在这种情况下，美国决策者们决定“集中化”情报组织。
1942年6月，战略情报局成立，多诺万任局长。这是美国第一个统一的中央情报机构。大战期间，多诺万与胡佛的矛盾甚多。
1942年10月，当多诺万手下的特工潜入西班牙驻墨西哥使馆偷拍一本海事密码簿时，FBI的人也赶到。警报嘶鸣，红灯忽闪，战略情报局的人只好逃走。多诺万对此大为恼火。
1943年，多诺万提出战略情报局与苏联内务人民委员会建立联系的计划，胡佛听到风声后，立即致信白宫，警告这样做会“对本国内部安全构成严重威胁”。最后该事件不了了之。
1944年11月，多诺万向罗斯福提议将战略情报局改组为一个新的对外情报局，即现在的中情局，直接对总统负责。由于该消息被泄露，建议没有实施。多诺万确信是胡佛从中作梗。
二战结束时，胡佛无可争议地成为美国国内情报机关的首脑，在战后海外情报的未决竞争中也获得同等机会。
但1946年1月，杜鲁门总统下令组建中央情报组，一年多后，成立中情局。两大机构一个主内，一个主外，但产生矛盾仍然在所难免。
至今，中情局人员仍然被联邦调查局视为知识分子、喝着葡萄酒、抽着烟斗、有时很冷淡的人，中情局则将联邦调查局人员看成抽雪茄、喝啤酒、敲门的警察。有美国媒体形容称，这真是一对“糟糕的朋友”。
赵继统在“25区”的事件中，为FBI落了大脸，胡佛感觉终于压了CIA局长赫尔姆斯一头，所以当CIA的招待处长科尔比要求归还“25区”基地时遭到了严厉的拒绝。
胡佛直接电告总统，CIA不过是个情报搜集机构，他的特工培训何必搞得神神秘秘？必须公开进行！
刚受其牵连的约翰逊深以为然，批准了将“25区”交给“特别事件调查&管理局”，作为培训美国本土“驱魔师”基地的使用计划。
美国本土由于“新教”的流行致使“驱魔牧师”这个行业的从业职几乎为零，才致使各处的邪教纷纷来美，各个派别支援的“驱魔牧师”又因为教义的问题，不适合驻扎在本土的教堂里
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