恢复了自己炸开的这只手，这三年间，也不止他发生了变化。
大蛇丸也在研究道路上取得了重大突破。
通过比对纲手和止水的血液样本，他成功的找到了代表千手一族，以及代表宇智波一族的基因片段。
随后他迫不及待的拿自己做实验，当然，是克隆体。
成功的在克隆体身上激发出了宇智波一族特有的阴遁查克拉，以及千手一族的旺盛生命力。
除此之外，他还找到了永恒万花筒和普通万花筒的基因片段区别。但找到这段基因，并不代表着止水的万花筒就可以进化成永恒万花筒了。
大蛇丸一直做实验，直到未来左助提供的血液样本几乎快用完的时候，他才确定，宇智波一族想要开启代表永恒万花筒的基因，必须要大量的，且质量极高的阴遁查克拉。
万花筒觉醒的过程本就是激发出这种查克拉，但由于血脉的退化，可以激发出来的阴遁查克拉不足，导致宇智波族人的觉醒过程不再完整，于是出现了普通万花筒和永恒万花筒的区别。
因陀罗的血脉就纯正的一比，体内的阴遁查克拉遗传自六道仙人，不仅质量高，还管饱。所以他觉醒的时候，直接一步到位。
而后世的宇智波一族发现移植父母兄弟姐妹的万花筒写轮眼，可以开启永恒万花筒的秘密。其实原理就是补全缺失的童力和阴遁查克拉，而父母兄弟之间的查克拉相当接近，不会出现排异反应。
这种高等级的阴遁查克拉，现在的忍界只有一个人有，那就是日向衍。
由于大左助之前往大蛇丸身上丢的别天神，导致大蛇丸面对日向衍的时候，完全没有一点隐瞒，直接就把全套方法交给了日向衍。
日向衍拿到技术后，又和大蛇丸一起，拿着克隆体做了十几个实验。确保全部成功之后，日向衍转身就跑回木叶，帮止水开启了永恒万花筒，以及激活了体内的千手基因。
除了这些之外，木叶村也发生了不小的改变。
由于木叶吞并砂隐村，接管火之国，原本还算比较充足的忍者储备显得有些不足了。
于是纲手扩大了忍者学校的规模，由原本的六岁上学改到了四岁上学，仍然是六年学制。然后增加了下忍学校，五年学制，毕业考试就是中忍考试。
忍者学校就像是前世的小学一样，主要是打基础，学习理论知识，以及思想教育。
下忍学校就像是前世的中学，在木叶改革之后，大量的c级忍术，乃至b级忍
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