次发生了巨大的改变。安纳托里亚正式偷袭基里托传送港，与帝国决裂。同日，做为其盟友的泛洛亚古传承联邦于东西两线全面反攻，形成三面夹击之势。接着，“光之魔导塔”的出现导致行星磁暴，所有电子物品全数瘫痪，洛亚世界科技文明在一夜之间整整倒退两百年。
冷兵器与魔法文明借此再次回归洛亚世界，而依靠电子科技装备的新地球军则在洛亚各种族的围攻下节节败退。
与之同时，由帝国内部原统和军部分人员引起的叛乱愈演愈烈，整个帝国在洛亚上的统治几近崩溃。于是，驻扎在缪籭斯和月色的新地球军不得不冒着行星磁暴的危险，超距离空投援军后方才挽住颓势，但有超过20万的新地球军士兵在大气圈中伴随着运输舰化为飞灰。大量的人员空缺，也直接影响到外空间战力，近60％的外空间战舰因人手不够而无法升空。
这样的情况，直到三年后磁暴的减弱以及克隆士兵工厂的大规模建设方才好转，只是空投损失仍在三分之一的比例上无法减少。
可惜的是，洛亚种族联盟的胜利并不意味着战争结束。行星磁暴不仅影响了电子设备，也造成无数的臭氧层空洞，大量的辐射导致动植物死亡，原本蓝绿相间的美丽行星，如今远远望去，多了大块大块斑斑点点的黄色斑纹，极为难看。
无论是在新地球军的辖地内，还是安纳托里亚或者古传承联邦，食物与绿洲都成了这个时代的主要矛盾。对于诸多普通民众来说，只要能填饱肚皮，就不再关心统治者的身份。失去了信仰，失去了明确的敌对目标，欲望与战乱由此滋生。整个洛亚行星表面，在三大主权国的名义下，以城与绿洲为核心分裂出了上百个势力，除非面临唇亡齿寒的危险境地，一般都是无暇他故。
即使名义上的三大主权国，除了以基因克隆士兵为主的帝国能维持大面积的领土外，古传承联邦仅有围绕传承之都的十座城市与七个绿洲，而安纳托里亚更是回到了游戏之城时期，只有一座主城尚能完全掌控。因此，除了三大势力不断的战争之外，围绕绿洲的争夺更是不断。
直到TH200年后，由于磁暴影响的逐渐弱化以及抗电磁干扰技术的普及，越来越多的电子科技兵器恢复了作用，势力之间的兼并也逐渐减少，洛亚表面似乎趋向平静。只是，这一切不过是暴风雨前的短暂宁和而已。几乎所有人都知道，随着行星磁场的恢复，更大的战争即将来临。
“时间轴已确定，偏差13351253秒……空间轴已确定，偏差5402340
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