虽然没有得到波克比的蛋，但玄间此行也算收获颇丰，不但收服了一队极有价值的化石神奇宝贝，烛光灵也成功进化成了灯火幽灵。找了个地方住下后，玄间和翔太立刻对化石精灵们进行了一些研究，撰写了一篇分量十足的论文后，才将它们传送给大木博士。这些精灵中，玄间打算重点培养的只有化石翼龙，不过化石翼龙对于玄间使用群殴将它打败不服，因此玄间和它约定以后正式打败它才算收服。至于现在，化石翼龙需要先回复一下上万年没活动的身体。
由于全身心投入了研究中，玄间对精灵们自然有些疏忽，没注意到妙蛙种子的异常。直到一天早上索罗亚慌慌张张跑来告诉玄间妙蛙种子丢失了，玄间这才意识到自己的疏忽。
“什么时候不见了的。”玄间急忙问道。
“应该是今天早上，我昨天晚上还见到它呢！”多轨说道，“妙蛙种子这两天食欲一直不好，我给它换了很多口味，但都效果不理想。”
“都是我不好，我这几天冷落了它，对它太不关心了！都是我的错！”玄间懊恼地说。
翔太连忙安慰道：“别急，我们先去现场看看。”随后便带头来到了妙蛙种子的卧室中。
此时，玄间已经强迫自己冷静下来，仔细的查看了一番卧室，并未发现外部入侵的迹象，如此一来，妙蛙种子被人抢走的可能被排除了。
“室内残留着催眠粉，从成分上分析很可能是妙蛙种子发出的，窗台上有藤鞭的勒痕和脚印，也是妙蛙种子留下的，在我看来，可能是妙蛙种子自己离开了。”翔太说着自己的调查结果。
“可是妙蛙种子为什么要离开呢？仅仅是玄间这几天的冷落应该不至于吧？”多轨提出了疑惑。
“也许可以问一问其他精灵，看看它们知不知道原因。”翔太提议道。
玄间立刻照做，但询问了半天，连和妙蛙种子关系最好的索罗亚都表示不清楚妙蛙种子离开的原因。难道真是因为自己冷落了它吗？玄间一时间沮丧极了。
多轨看出了玄间的沮丧，连忙提醒道：“不管怎么说，先将妙蛙种子找回来再说其他的！”
“对，”玄间醒悟过来，连连点头：“没错，妙蛙种子在外边很可能遇到危险，我们必须要将它找回来。可是要怎么办呢？”
翔太望着方寸大乱的玄间摇了摇头，平时多么果决多智的一个人，现在居然如此六神无主，真是关心则乱啊！想了想，翔太说出了自己的建议：“如果能够有一只擅长追踪的精灵帮
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