们坚信这个保护程序能够帮助他们抵抗肃正协议的入侵，为此他们还专门建立了一个环世界用来作为保护协议的载体。而接下来的战争就进入了另外一个阶段，拥有一个环世界作为载体的保护协议，并不害怕单枪匹马仅仅只是几个行星堡垒进入到银河系的肃正协议。
毕竟利用恒星作为能源赛博格叛军还有各大文明给保护协议建立了强大的量子计算机组，要知道各大文明在对抗肃正协议的时候，他们都是保持着通讯静默并且关闭了舰队的协同网络，这样做主要是为了防止肃正协议和赛博格入侵他们舰队的网络接管一部分舰队。
就这样战争足足打了将近一个世纪之久，直到肃正协议和赛伯格发现了保护协议的中心枢纽之后，这种僵持了将近一个世纪之久的战争终于迎来了结束。
将近十多个行星堡垒强行跳跃到了保护协议的中心指挥枢纽这边，而中心指挥枢纽这一边则聚集着大量的联军舰队，数以千计的泰坦还有数以百万计的舰队皆在这一战当中损失惨重。
因为这些行星堡垒的火力实在是太强了，每一个火力投送口的火力就相当于一艘战列舰，更何况这些行星堡垒只是来稳定跳跃场的而已大部队还在后面。
联军舰队在损失了大量舰船将这十几个行星堡垒击毁掉之后，却惊恐的发现越来越多的大质量物体正在突破超空间。而联军舰队在损失掉了90%之后余下的舰船纷纷开启了紧急跳跃逃离了这个星系，在偌大的银河系当中过起了游牧般的生活。
接下来肃正协议和赛博格文明便没有在银河系当中遇到什么比较大的抵抗力量了，大部分文明都利用自己文明建立的方舟计划，乘坐着自己种族建立的末日方舟离开了银河系前往了未知的星系。
而接下来肃证协议连带着赛博格文明在银河系中央建立了一个庞大的监听阵列，而这个阵列则是建立在一颗脉冲星的旁边的，其主要目的还是利用这一颗脉冲星来提供能量毕竟这个监听阵列消耗的能量也不少。
这个监听阵列能够监听到银河系范围当中的所有空间波动，随后那些流亡舰队便遭到了肃正协议还有赛博格的清剿，以至于银河系在接下来足足1000年当中没有再出现过一丝由文明产生的空间波动。
在又过去了1000年之后，肃正协议等这一部分子程序便在银河系当中陷入了沉睡，他们正在等待下一轮的收割。而已经作为肃正协议忠实走狗的赛博格文明也和它们的主人一样陷入了沉睡，打算等到下一波文明成长起来之后，对其进行收割。
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