万历对这间书房很是满意，准备往后就在书房内学习思考，而政务处理还是放在外面。他觉得这样可以给自己树立一个公私分明的良好形象。而且看奏本处理政务时他往往还得应付随之而来的司礼监诸人以及一些官员，万历可不想把自己的书房变成接待臣下的地方。
本来他还打算弄个泥炉子，搞套茶具自娱自乐一下，反正如今这宫里鸡缸杯之类的茶具要多少有多少。不过万历穿越前就不是特别喜欢这些把戏，想想还是作罢，连菜都要别人帮着夹的皇帝，忽然变成自己烧开水泡茶喝，传出去只怕会引起轰动。
新书房弄好没两天，万历又来到文华殿继续学习《大明会典》。这一次他学习依然很认真，但对申时行的态度却有了些许的改变，礼貌而不亲近。申时行很敏锐地觉察出来，但也没有说什么，仍是很尽职地给皇上授课。
等课业基本结束，申时行才取出一叠稿纸呈给万历，道：“皇上，这是本次重新编订《会典》将要添加进去的一部分内容，还请皇上事先御览一下，下次日讲时，微臣会对其详加讲解。”
万历拿起几张一看，才知道是关于一条鞭法、考成法等近年新颁行的政令法规的纲要。这正是他目前迫切需要了解的内容，当下便认真阅读起来。
申时行又道：“元辅是本次修订《会典》总裁官，对于皇上学习《会典》很是关注，特意关照微臣要将本次拟新增的条目向皇上细细解说。”
万历一听这话，没怎么在意，毕竟新法都是在张居正的推动下实施的，他作为《会典》的总编，又是自己的老师，肯定会希望自己的学生多关注一下这些内容。当下边继续看稿纸边回道：“嗯，倒是让老先生挂心了。”
申时行又道：“这几年朝廷刷新政治，百事转苏，四境安宁，元辅所倡导这几条律法确实是至关重要。如冯大伴等至始至终亲历其事者，想来体会更深。”
万历听得这话，目光一滞，总算反应过来。略略思考了一下才放下稿纸对申时行道：“朝局日新，申先生你也是功不可没。这几次听讲，朕自觉受益匪浅，往后还要辛苦先生多多指点。”
申时行一听，晓得万历已经明白了自己苦衷，还说自己功不可没，往后还要自己多多指点，心中很是激动，向万历拜谢道：“皇上谬赞，微臣愧不敢当。皇上不以臣愚钝，令臣侍讲，以补万一，唯尽心竭力以报圣恩。”
于是君臣间的气氛又恢复如初，临别时，万历又依例对申时行与沈鲤赏物赐饭，才回到乾清宫。
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