有了剿饷的保证，五省总督孙传庭终于看到了剿灭流寇的希望，四正六隅、十面埋伏的作战部署，已经传到到各地，接下来就看孙传庭如何的部署了。
秋收季节的时间，孙传庭将自己关在屋子里足足半个月的时间，他一直都在思考和定夺如何剿灭李自成和张献忠两路流寇，李自成和张献忠麾下的流寇，号称都是几十万人，从孙传庭掌握的情报来看，两路流寇的兵力都在十万人以上，而且经过了长时间的征战厮杀，流寇的战斗力也有一定程度的提升，朝廷大军想着一次性的同时剿灭两路流寇，显然存在很大的困难，最好的作战安排是各个击破，以主力剿灭其中一路流寇，以各地军队防御另外的一路流寇，防止李自成和张献忠的联合。
究竟首先剿灭哪一路的流寇，孙传庭经过深思熟虑之后，认为首先对付张献忠，这是因为张献忠的力量相对来说要弱一些，且张献忠麾下的刘文秀、李定国和艾能奇等人作战勇猛，这些人都有独当一面的能力。
张献忠盘踞在湖广的襄阳和郧阳等地，且开始向四川一带渗透，四川的地形异常的复杂，很多地方都是易守难攻，若是让张献忠彻底打通了前往四川的道路，那么日后的作战将变得更加的艰难。
孙传庭麾下的大军驻扎在武昌府一带，距离襄阳不是很远，按照四正六隅的作战部署，要求四川、陕西以及河南等地协同作战，就能够彻底堵死张献忠所有的逃跑路线，当然孙传庭最为担心的一点，就是张献忠和李自成的联合。
一般情况之下。张献忠和李自成是不可能联合的，两人都是流寇多年的首领，各自都不服气，联合起来会形成一山不容二虎的局面，故而孙传庭可以放心大胆的供给张献忠，不过这里面也有一个条件。那就是必须要以主力单独进攻张献忠，而以其他的力量阻止李自成，可能李自成巴不得这样的局面出现。
六月底，孙传庭的作战思路基本形成。
让孙传庭想不到的是，他的作战思路首先就遭遇到监军王永吉的反对。
皇上下旨征收剿饷，保证朝廷大军剿灭流寇的粮草，就是想着在最短的时间之内彻底剿灭流寇，且皇上在圣旨之中明确说了，让大明百姓忍受一年的时间。这说明皇上对流寇肆掠的情形已经是非常的痛恨了，不惜增加百姓的负担，举全国之力剿灭流寇，如此的情况之下，不展开全面的进攻，单单打击张献忠一路的流寇，皇上和朝廷怎么可能答应。
孙传庭据理力争，与王永吉两人甚至产生了矛盾和意见。
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